面积占东京都西部1/3、人(rén )口超过230万、八成以上由学生组成的学园都市，尖端科技发展迅速，超能力开发已经深入到城市的(de )各个角落。超能力水(shuǐ )平高达Level 5的御坂美(měi )琴（佐藤利奈 配音）如往常一样和初春饰利（丰(fēng )崎爱生 配音）、白井黑子（新(xīn )井里美 配音）等好友过着平凡的日子，间或热血爆发挫(cuò )败各(gè )种扰(rǎo )乱城市的阴谋。某天，在调查一起现今卡事件时她邂逅了(le )长点上机学园的布束砥信（叶山郁美 配音），从而得知用美琴的DNA大批量复制超能力者的“量产型能力(lì )者计划”。不安定的气氛在都市角落肆意蔓延……
　　本片为镰池和马（原作）、冬川基（作画）的原作《魔法(fǎ )禁书目录》的外传漫画第二季TV动画。